или проще:
у бодрствующих собак в свободном поведении

Я почти десять лет проработала на крысах -- бодрствующих в [условиях] свободного поведения. Это означало, что крыса во время опыта сидит (или спит, или ест, или перемещается -- чего ей больше хочется в данный момент) в довольно просторной клетке, а от нее тянутся к приборам разнообразные катетеры и электроды. Именно так и писали во всех отечественных статьях. В статьях, предназначенных для зарубежной печати, писали "conscious unrestrained". Другой английский вариант -- "alert", использовали взаимозаменяемо.

P. S. Мой вариант не исключает варианта "ненаркотизированные собаки", однако фразу "собаки, которые не были фиксированы" я бы ни за что не написала.

Ну и примеров в сети много, первые две ссылки из Яндекса:

...свойства вещества СМ-345 были также изучены на модели НРС у бодрствующих собак с ... Через 24 часа после операции у собак в свободном поведении регистрировали ЭКГ во II стандартном отведении.
www.incart.ru/atts/2390/239008.pdf

Аритмия у бодрствующих собак по ... Через 24 часа у собак в свободном поведении регистрировали стойкие нарушения ритма сердца на ЭКГ...
ntpo.com/patents_medicine/medicine_6/medicine_263.shtml