Los antígenos SELF son aquellos que, si bien desencadenan una respuesta en el sistema inmune, son tolerados por este. Mientras que los antígenos NO SELF, son considerados extraños y generan una respuesta inmune de defensa. Cuando el sistema inmune responde ante un antígeno SELF se producen las llamadas enfermedades autoinmunes (LUPUS, etc)
Si bien no hay una traducción literal del término SELF y NO SELF al castellano, puede traducirse la frase como "repertorio normal de antígenos propios".

Autoantígeno:

Tejido u órgano que se comporta como un antígeno ante el organismo al cual pertenece. Esta nueva y anormal aptitud antigénica que demuestra una alteración del sistema inmunológico aparece en tres casos:

1. cuando el tejido ha sido modificado por una infección, una intoxicación, una irradiación, una neoplasia (autoantígeno adquirido);

2. cuando las células del tejido han fijado un antígeno extraño, por ejemplo, un virus (seudoautoantígeno - pseudoautoantígeno);

3. cuando un autoantígeno natural ha penetrado accidentalmente en la circulación; estos autoantígenos naturales son sustancias naturalmente antigénicas, pero que normalmente no provocan la formación de anticuerpos (autoanticuerpos) en el organismo al cual pertenecen ya que están aislados de las células inmunocompetentes generadoras de los anticuerpos: cristalino, tracto uveal, tiroides, espermatozoides, mielina. En estos tres casos aparecen anticuerpos séricos o celulares que reaccionan contra el tejido alterado y el tejido análogo sano, provocando lesiones y trastornos funcionales (enfermedad autoinmune)